Код:
<script type="text/javascript">
    forum = "cсылка на форум"

    str = document.getElementById("navpm").innerHTML
    loc = new String(document.location)

    if( (str.indexOf("(") != -1) && document.referrer.indexOf(forum)==-1 && loc.indexOf('messages.php')==-1)
    { 
      count = parseInt(str.substring(str.indexOf("(")+1,str.indexOf(")")))

      if (count==1) text="У вас есть 1 новое сообщение"
      else if (count>1 && count<5) text="У вас есть " +count+" новых сообщения"
      else text="У вас есть " +count+" новых сообщений"

      msg =  "<div id=\"new-mes\" class=\"container\" style=\"position: absolute; z-index=2; left: 40%;\">"
      msg += text
      msg += "<br><a href=\"\" onclick=\"document.location.replace('messages.php'); document.getElementById('new-mes').style.display='none';return false;\">Посмотреть личные сообщения</a>"
      msg +="<br><a href=\"\" onclick=\"document.getElementById('new-mes').style.display='none'; return false\">Закрыть окно</a>\r\n" 
      msg += "</div>"

      document.getElementById("pun-status").innerHTML += msg
    }
    </script>